По предложению Академии наук Российско-Американская компания приняла участие в магнитных наблюдениях, которые производились по соглашению Россией и Англией. С этой целью в 1841 г. близ Ново-Архангельска, на острове Японском, была построена обсерватория. Чертеж для постройки обсерватории и все необходимые инструменты присланы были Академией наук. Российско-Американская компания приняла расходы по оплате присланного Академией директора обсерватории и его помощника.
Неделькович, временно исполнявший в июле 1864 г. обязанности «заведующего компанейским хронометром», который необходимо было «ежедневно заводить и сличать и по временам поверять», отмечал, что хронометры «все почти здесь весьма удовлетворительны, а в случае их порчи, при первом случае, отправляются в Калифорнию для исправления».
Таким образом, помимо сбора зооботанических и этнографических материалов для Петербургской Академии наук в колониях продолжалась работа по усовершенствованию местного краеведческо-этнографического музея, комплектованию библиотеки и благоустройству обсерватории для постоянных магнитных и метеорологических наблюдений.
Не случайно период с 80-х годов XVIII в. называют четвертым (после первозаселения) периодом открытия Америки со стороны Азии, поскольку наряду с начавшимся заселением русские интенсивно продолжили географическое изучение территории Аляски и частично Калифорнии. С середины XVII в. русские обогатили картографические представления о Северо-Западной Америке: первое в мире изображение Аляски в виде фантастического острова появилось около 1700 г. на чертеже-карте С.У. Ремезова — В.В. Атласова; географические открытия И. Федорова — М. Гвоздева (1732 г.), две экспедиции В. Беринга — А. Чирикова (1728 и 1741 гг.) расширили конкретные знания об Америке и послужили основой дл^ создания новых, более точных географических карт; с 1743 г. до 80-х годов XVIII в. новые картографические сведения появились в итоге плаваний русских промысловиков, а также правительственной экспедиции Креницына и Левашова (1764–1769 гг.).
Новый этап в русской картографии Аляски открылся после плавания в северных водах Тихого океана третьей экспедиции Дж. Кука — Ч. Клерка, создавшей наиболее точную по сравнению со всеми предшествующими общую карту Аляски.
Итоговую карту открытий, совершенных третьей экспедицией Кука, капитан Клерк, возглавивший эту экспедицию после гибели Кука, передал в июне 1779 г. главному командиру Камчатки премьер-майору М. Бему. Бем в том же июне месяце отбыл в Петербург. В Иркутске эту карту отобрал у него иркутский губернатор Ф.Н. Кличка. В конце 1779 г. в Иркутске секунд-майором М. Татариновым была составлена «Карта около Северного полюса всему Северному океану с показанием поисков в Ледовитом океане також в Тихом море господ офицеров морских российских, английских и гишпанских».
Первое добавление к карте Кука — Клерка последовало вскоре по возвращении в Анадырск из похода на острова Диомида в Беринговом проливе казачьего сотника Ивана Кобелева (1779 г.). Представленные Кобелевым журнал похода и «чертеж без расстояния» позволили Татаринову в том же году составить карту Чукотки и Аляски. Карту Кобелева отличает не только наличие многочисленных эскимосских поселений на Американском материке, но и впервые обозначенный залив на побережье Северного Ледовитого океана, открытый лишь в 1816 г. Коцебу и названный именем последнего. Загоскин предполагал, что в 1778 г. суровые ледовые условия способствовали тому, что «знаменитый Кук прошел мимо этого залива, вовсе его не заметя». Отдавая должное карте Ивана Кобелева, исследователь-гидрограф М.Д. Тебеньков писал в 1852 г.: «Сотник Кобелев по указанию туземцев составил очерк берегам Америки к северу и к югу от [Берингова] пролива, который послужил впоследствии к открытию, или лучше сказать к отысканию заливов Коцебу, Шишмарева и других». Нужно сказать, что карта Кобелева 1779 г. наравне с картой Кука — Клерка оказала сильное влияние не только на «Карту Шелехова странствования» (1791 г.) и итоговую карту, составленную под руководством Шелихова (до 1795 г.), но и на значительное число карт, датируемых до 1807 г. На всех этих картах показана впадающая с северо-востока в залив Нортон река Хеуверен.
С именем Ивана Кобелева, а также чукчи-картографа Николая Ивановича Дауркина связано открытие еще одного залива на американском берегу в районе Берингова пролива, мимо которого, не заметив, прошел Кук: в 1791 г. Кобелев и Дауркин с отрядом чукчей на байдарах пересекли Берингов пролив и первыми из россиян высадились на Американском материке против Чукотского носа, стремясь войти в «губу Хеуверенскую», т. е. в довольно глубокий залив Порт-Кларенс. По описанию плавания Кобелева и Дауркина этот залив и впадающая в него река «Хеуверен» (совр. Кузитрин) были показаны на карте экспедиции Биллингса-Сарычева 1789–1791 гг.
Большое значение в последнее десятилетие XVIII в. имели исследования русских в заливе Аляска и картирование архипелага Александра. Русским промысловикам, поселившимся на Кадьяке, на Кенайском полуострове и у мыса Св. Ильи (мыс Саклинг) на Американском материке, очень скоро стало известно, что «Большая или Кукова река» — это не река, а залив, который они назвали Кенайским; что из этого залива есть путь с волоком в соседний Чугатский залив; что полуостров Аляску можно пересечь, начав путь из залива Камышак (на западной стороне Кенайского залива). В этом немалая заслуга штурманов Д. Бочарова и Г. Измайлова — служащих компании Шелихова — И.И. Голикова. Ванкувер в 1794 г. отмечал, что если бы не исследования русских промысловиков, еще долгие годы на картах существовала бы вместо Кенайского залива «Кукова река». Картографические работы, проводившиеся в этих широтах в 80-х годах XVIII в. испанцами, были настолько засекречены, что почти не имели влияния на развитие мировой картографической науки.